ESTUDIOS DE ASOCIACIÓN GENÓMICA (GWAS) Y PREDICCIÓN GENÓMICA DE RASGOS COMPLEJOS

01 – 29 junio 2027
Clases vía zoom – martes y jueves de 18:00 PM – 20:30 PM (Chile)
1 o 2 sábados al mes de 10:00 -14:30 PM (Chile)

DESCRIPCIÓN DEL CURSO

El curso avanzado de “Estudios de Asociación Genómica (GWAS) y Predicción Genómica de Rasgos Complejos” es un curso de postgrado avanzado en cual los estudiantes explorarán los fundamentos de los estudios de asociación genómica (GWAS), que buscan identificar variantes genéticas asociadas con rasgos específicos de interés económico en producción animal y acuicultura. Además, el curso introducirá a los alumnos en los análisis de predicción genómica, una poderosa herramienta ampliamente utilizada en la selección de reproductores. Esta técnica se basa en usar la información genómica y fenotípica de los animales para estimar el valor genético de los individuos. Los estudiantes aprenderán a distinguir entre modelos predictivos clásicos como el GBLUP y métodos modernos basados en algoritmos de aprendizaje automático como árboles de decisión o bosques aleatorios.

El trabajo práctico se centra en el análisis de estudios de caso reales, utilizando el supercomputador Océano de la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso (https://hpc.pucv.cl), y aplicando técnicas modernas de Ciencia de Datos a través de diferentes lenguajes de programación como Linux, R y la plataforma Posit Cloud (https://posit.cloud). Este enfoque promueve la integración de conocimientos teóricos y prácticos, brindando a los estudiantes la oportunidad de aplicarlos en la resolución de problemas reales en el ámbito de la mejora genética y la genómica aplicada.

OBJETIVOS DE APRENDIZAJE

Al término del curso el estudiante será capaz de:

1) Comprender los principales tipos de análisis genómicos aplicados en mejora genética animal y de acuicultura: GWAS y Predicción genómica.

2) Realizar de forma guiada análisis genómico utilizados en mejora genética animal y de acuicultura tales como: estructura poblacional, ancestría, parentesco genómico, asociación genómica y predicción genómica usando algoritmos tradicionales y de aprendizaje automático.

PERFIL DEL PARTICIPANTE

Profesionales, graduados o investigadores interesados en la mejora genética y la genómica aplicada a la producción animal y a la acuicultura.

DIRECTOR DEL PROGRAMA

Dr. José Gallardo Matus
Profesor titular en la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso.
Doctor en Ciencias por la Universidad de Chile.

PROFESORES INVITADOS

Pendiente

INSTRUCTOR DE LABORATORIO

Dr. (c) Sergio Barahona
Bachiller en Genética y Biotecnología por la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Perú.
Estudiante de Doctorado en Biotecnología. Programa conjunto entre la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso y la Universidad Técnica Federico Santa María.

PATROCINA

Pendiente

PLAN DE ESTUDIOS

Clase 0. Presentación de los participantes y habilitación de recursos de aprendizaje.
Clase 1. Introducción a la genómica poblacional.
Clase 2. Práctica de genómica poblacional.
Clase 3. Introducción a los Estudios de Asociación genómica.
Clase 4. Práctica de estudios de asociación genómica.
Clase 5. Introducción a la predicción genómica en animales.
Clase 6. Práctica de predicción genómica en animales.
Clase 7. Métodos avanzados de predicción genómica en animales.
Clase 8. Práctica métodos avanzados de Predicción genómica en Animales.
Clase 9. Métodos de predicción genómica basados en Machine Learning.
Clase 10. Práctica métodos de predicción genómica basados en Machine Learning.

REQUISITOS DE CONOCIMIENTOS TEÓRICOS Y COMPETENCIAS PRÁCTICAS

Programación (Excluyente): Se recomienda que los participantes cuenten con conocimientos básicos de programación en los lenguajes R y Linux. Estudiantes sin experiencia previa en programación no deberían inscribirse en el curso.

Hardware y software: Es indispensable que cada participante disponga de una computadora personal con acceso a internet. Además, será necesario instalar dos software para garantizar una conexión segura (https://www.putty.org) y realizar transferencias de archivos (https://cyberduck.io) al sistema de cómputo de alto rendimiento (HPC) Océano de la PUCV.

Inglés: Todos los programas de software y los códigos de programación que se utilizarán en el curso están disponibles únicamente en inglés. Por lo tanto, los estudiantes que no tengan conocimientos de lectura en inglés no deberían inscribirse en este curso.

VALOR CURSO Y MATRÍCULAS

Valor curso: CLP$ 400.000; (US$400 dólares americanos).
Inscripciones comienzan en Enero 2026.
Formas de pago: Contado, tarjetas de crédito y orden de compra empresas
Consultas: genomica.aplicada@pucv.cl

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Matrícula para PÚBLICO GENERAL (CHILE): Valor completo sin descuento.
Matrícula para ALUMNI PUCV (CHILE): Incluye Beca equivalente al 10% para ex alumnos graduados de la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso.
Matrícula para FUNCIONARIO PÚBLICO O ALUMNO DE POSTGRADO (CHILE): Incluye Beca equivalente al 15% de descuento para funcionarios de instituciones públicas o estatales chilenas y para alumnos de postgrado chilenos o extranjeros con residencia en Chile.
Matrícula para ALUMNOS EXTRANJEROS: Incluye Beca equivalente al 20% de descuento para alumnos extranjeros sin residencia en Chile.

ASISTENCIA Y CERTIFICACIÓN

Se entregará certificación de PARTICIPACIÓN del curso a los alumnos que alcancen un 80% de asistencia a las clases sincrónicas. La certificación oficial de PARTICIPACIÓN del curso se entregará 2 o 3 semanas después de finalizar el curso.

¿DÓNDE TRABAJAN LOS GRADUADOS DE NUESTROS CURSOS Y DIPLOMADOS?

CHILE: ADL Diagnostic, Antufen Seeds, Aquabench, Aquachile, AquaGen, Austral-Omics, Blue Genomics Chile, Cargill Aqua Nutrition, Benchmark Genetics Chile SPA, Cargill Innovation Center, Cermaq, CESSO E.I.R.L., Centro IDEAL, Centro de entomología aplicada Ltda, Centro de Genómica Nutricional Agroacuícola, Consultores independientes, Electroarnez, Empresas Aquachile, Fraunhofer Chile, Fundación Ciencia y Vida, Farmacología en Aquacultura Veterinaria FAV S.A., Inacap, Instituto de Desarrollo Agropecuario (INDAP), Instituto de Investigaciones Agropecuarias de Chile (INIA), Invermar, Liceo Carmen Rodriguez Henriquez de Tongoy, MSD Salud Animal, ML Agroservicios, Mowi, MultiX, Salmones Antártica, Salmones Aysen, Salmones Blumar, Salmones Camanchaca, Salmones de Chile, Sernapesca, TAAG Genetics, Universidad Andrés Bello, U. Adolfo Ibáñez, U. Arturo Prat, U. de Chile, U. de los Lagos, U. de Antofagasta, U. del Alba, U. de Atacama, U. Austral de Chile, U. Católica de Temuco, U. Católica del Norte, Universidad San Sebastián, U. Santo Tomás, U. de la Frontera, U. de Valparaíso, U. de Talca, Universidad Técnica Federico Santa María, U. de Magallanes, U. de O’Higgins, U. de Playa Ancha, U. tecnológica Metropolitana, Pontificia Universidad Católica de Chile, Solver, Vitapro Chile, WSP Ambiental.

INTERNACIONAL: Argentina: Universidad de Buenos Aires, Ministerio de Producción y Agroindustria de la Provincia de Río Negro; Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (CONICET); Bolivia: Consultor independiente, Universidad Mayor de San Andrés; Brasil: Universidad de São Paulo, Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais; Canadá: Consultor independiente; Colombia: AGROSAVIA, U. Francisco de Paula Santander, Autoridad Nacional de Acuicultura y Pesca-Colombia, Universidad de La Sabana; Dubai: Pure Salmon; Ecuador: Agrantech, Alimentsa, Biomar, Cargill, GrupoAlmar, Hendrix Genetics, Holstein Ecuador, La Chamecita S.A.S., Produmar, Centro de Investigación Marina y Acuícola (CENAIM), Escuela Superior Politécnica del Litoral, Escuela Superior Politécnica Agropecuaria de Manabí, Ministerio de Agricultura y Ganadería, Universidad Estatal del Sur de Manabí, Universidad Estatal Amazónica, Universidad de Camagüey; Honduras: Universidad Nacional Autónoma de Honduras; España: Apeel Sciences Spain SL; México: Laboratorio Estatal de Salud Pública (LESP), Universidad de Nariño, Universidad Autonoma de Coahuila, U. Autónoma de Nayarit, Colegio de Postgraduados (Colpos), Laboratorios Vitalab, Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto Politécnico Nacional-CIIDIR Sinaloa, Instituto de Salud del Estado de Chiapas, Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR); Nueva Zelanda: New Zealand King Salmon; Perú: Instituto Nacional de Salud, Instituto Nacional de Innovación Agraria, Consultor independiente, Universidad Científica del Sur, Universidad Nacional Agraria La Molina, U. Nacional Jorge Basadre Grohmann, Universidad Nacional de Trujillo, Universidad del Tolima, Universidad Nacional del Altiplano, Universidad Nacional del Callao, Universidad Nacional del Santa, Universidad Nacional San Cristóbal de Huamanga; Organismo Nacional de Sanidad Pesquera y Acuícola; POOLFARM, PROGENETICS PERU EILR; Uruguay: Universidad de la República.