Diplomado en Mejora Genética y Genómica Aplicada.

01 abril – 29 julio 2027
Clases vía zoom
martes y jueves de 18:00 PM – 20:15 PM (Chile)
1 o 2 sábados al mes de 10:00 -14:30 PM (Chile)

DESCRIPCIÓN DEL DIPLOMADO

El Diplomado en Mejora Genética y Genómica Aplicada ofrece una formación integral diseñada para optimizar la producción, la sostenibilidad y la calidad en la industria animal y acuícola. A través de una combinación de fundamentos teóricos y aplicaciones prácticas, los participantes aprenderán desde conceptos básicos de genética mendeliana y cuantitativa, hasta el análisis de datos de secuenciación masiva (NGS) en supercomputadoras, y el uso de herramientas avanzadas como los estudios de asociación genómica, predicción genómica con técnicas tradicionales y de “Machine Learning”. Este diplomado busca capacitar a los profesionales para abordar los desafíos de la industria de producción animal y  de acuicultura con soluciones basadas en ciencia y tecnología de vanguardia.

El programa incluye cuatro cursos que abarcan desde una sólida introducción a la mejora genética y genómica, hasta un proyecto personal que permite a los estudiantes aplicar los conocimientos adquiridos en un contexto real. Destaca en el Diplomado, que el trabajo práctico se centra en el análisis de estudios de caso reales, utilizando el supercomputador Océano de la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso (https://hpc.pucv.cl), y aplicando técnicas modernas de Ciencia de Datos a través de diferentes lenguajes de programación como Linux, R y la plataforma Posit Cloud (https://posit.cloud). Este enfoque promueve la integración de conocimientos teóricos y prácticos, brindando a los estudiantes la oportunidad de aplicarlos en la resolución de problemas reales en el ámbito de la mejora genética y la genómica aplicada.

Finalmente, el Diplomado en Mejora Genética y Genómica Aplicada se distingue por su cuerpo docente de excelencia, el respaldo de la Asociación Latinoamericana de Genética y la colaboración de empresas líderes en tecnologías genómicas de vanguardia. Esta combinación ofrece una oportunidad excepcional para quienes aspiran a liderar la transformación genética y genómica en las industrias de producción animal y acuicultura, marcando el camino hacia un futuro más innovador y sostenible.

OBJETIVOS DE APRENDIZAJE

Al finalizar el Diplomado los alumnos serán capaces de:

1.- Explicar los principios básicos de la mejora genética aplicada en producción animal y acuicultura.
2.- Estimar parámetros genéticos como la heredabilidad, el coeficiente de parentesco, el Índice de Paternidad (PI), la Probabilidad de Exclusión (PE), el coeficiente de coascendencia y la endogamia.
3.- Resolver problemas de genética relacionados al estudio del parentesco, la paternidad y la endogamia en genealogías simples y complejas usando programación.
4.- Explicar los principios básicos de las tecnologías de secuenciación masiva (NGS) y de genotipificación por microarreglos aplicada en contextos de mejora genética animal y de acuicultura.
5.- Realizar un pipeline de análisis genómico a partir de datos de secuenciación masiva (NGS) incluyendo el filtrado, alineamiento, mapeo a un genoma de referencia y llamado de variantes.
6.- Comprender de forma básica los principales tipos de análisis genómicos aplicados en mejora genética animal y de acuicultura: GWAS y Predicción genómica.
7.- Realizar de forma guiada análisis genómico utilizados en mejora genética animal y de acuicultura tales como: estructura poblacional, ancestría, parentesco genómico, asociación genómica y predicción genómica usando algoritmos tradicionales y de aprendizaje automático.
8.- Diseñar, ejecutar y presentar un proyecto personal de análisis de datos en el ámbito de la mejora genética y la genómica aplicada, integrando análisis exploratorio, modelamiento predictivo y comunicación efectiva de resultados.

PERFIL DEL PARTICIPANTE

Profesionales, graduados o investigadores interesados en la mejora genética y la genómica aplicada a la producción animal y a la acuicultura.

DIRECTOR DEL PROGRAMA

Dr. José Gallardo Matus
Profesor titular en la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso.
Doctor en Ciencias por la Universidad de Chile.

PROFESORES INVITADOS

Pendiente

CONFERENCISTAS INVITADOS

Pendiente

INSTRUCTOR DE LABORATORIO

Dr. (c) Sergio Barahona
Bachiller en Genética y Biotecnología por la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Perú.
Estudiante de Doctorado en Biotecnología. Programa conjunto entre la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso y la Universidad Técnica Federico Santa María.

PATROCINA

Pendiente

PLAN DE ESTUDIOS

CURSO BÁSICO – INTRODUCCIÓN A LA MEJORA GENÉTICA.*
Subtópico 1.1.- Herencia de rasgos mendelianos.
Subtópico 1.2.- Parentesco y endogamia.
Subtópico 1.3.- Pruebas de paternidad y principios de genética poblacional.
Subtópico 1.4.- Herencia de caracteres cuantitativos.
Subtópico 1.5.- Diseño y estructura de programas de mejora genética animal y de acuicultura.
Subtópico 1.6.- Resultados de programas de mejora genética y estudios de caso.
Subtópico 1.7.- Introducción a los estudios de asociación genómica y selección genómica.

CURSO INTERMEDIO – LINUX Y HPC PARA GENÓMICA*
Subtópico 2.1.- Introducción al HPC Océano y Linux para genómica.
Subtópico 2.2.- Análisis de secuencias cortas NGS.
Subtópico 2.3.- Alineamiento-Mapeo a genoma de referencia.
Subtópico 2.4.- Llamado de variantes.
Subtópico 2.5.- Genotipificación por RAD-seq y microarreglos.

CURSO AVANZADO 1 – ESTUDIOS DE ASOCIACIÓN GENÓMICA (GWAS) Y PREDICCIÓN GENÓMICA DE RASGOS COMPLEJOS*
Subtópico 3.1.- Análisis de genómica poblacional.
Subtópico 3.2.- Estudios de asociación genómica GWAS.
Subtópico 3.3.- Predicción genómica con modelos clásicos GBLUP.
Subtópico 3.4.- Introducción al modelamiento predictivo con machine learning.
Subtópico 3.5.- Entrenamiento y validación de modelos predictivos de regresión.
Subtópico 3.6.- Entrenamiento y validación de modelos predictivos de clasificación.
Subtópico 3.7.- Predicción genómica con algoritmos de machine learning.

CURSO AVANZADO 2 – PROYECTO PERSONAL DE MEJORA GENÉTICA Y GENÓMICA APLICADA
Subtópico 4.1: Análisis exploratorio de datos fenotípicos, genéticos y/o genómicos.
Subtópico 4.2: Aplicación de métodos tradicionales y/o avanzados de mejora genética y genómica animal.
Subtópico 4.3: Comunicación de resultados.

• Los cursos básico, intermedio y avanzado 1 se pueden realizar de manera independiente del programa completo del Diplomado.

REQUISITOS DE CONOCIMIENTOS TEÓRICOS Y COMPETENCIAS PRÁCTICAS

Título profesional o licenciatura.

Programación (Deseable): Este curso está diseñado para participantes con conocimientos básicos en programación con R y Shell de Unix. Sin embargo, aquellos que no cuenten con estas habilidades tendrán la oportunidad de adquirirlas a lo largo del diplomado, lo que les permitirá desarrollar una comprensión avanzada de los temas abordados.
Hardware y software: Es indispensable que cada participante disponga de una computadora personal con acceso a internet. Además, para el curso intermedio y los cursos avanzados, será necesario instalar dos software para garantizar una conexión segura (https://www.putty.org) y realizar transferencias de archivos (https://cyberduck.io) al sistema de cómputo de alto rendimiento (HPC) Océano de la PUCV. Finalmente, tres software, necesarios para las clase 8 y 9 del curso intermedio, solo están disponibles en sistema operativo Windows y tienen requerimientos específicos. Software Axiom Analysis Suite: Sistemas operativos Microsoft Windows 10 (64 bits) Professional y sistemas Quad Core de 2.83 GHz con una memoria RAM recomendada de 32 GB.
Inglés: Todos los programas de software y los códigos de programación que se utilizarán en el curso están disponibles únicamente en inglés. Por lo tanto, los estudiantes que no tengan conocimientos de lectura en inglés no deberían inscribirse en este Diplomado.

VALOR MATRÍCULAS Y ARANCEL DIPLOMADO

Valor matrícula: CLP$ 400.000; (US$400 dólares americanos).
Arancel mensual: 3 cuotas de CLP$ 400.000; (US$400 dólares americanos). Pagados al 30 de abril, 30 de mayo y 30 de Junio. Alumnos que no paguen en las fechas establecidas serán eliminados del programa.
Costo total del diplomado: CLP$ 1.600.000; (US$1.600 dólares americanos). Incluye matricula más arancel.
Inscripciones comienzan en Enero 2026.
Formas de pago: Contado, tarjetas de crédito y orden de compra empresas.
Consultas: genomica.aplicada@pucv.cl

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Matrícula para PÚBLICO GENERAL (CHILE): Valor completo sin descuento.
Matrícula para ALUMNI PUCV (CHILE): Incluye Beca equivalente al 10% para ex alumnos graduados de la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso.
Matrícula para FUNCIONARIO PÚBLICO O ALUMNO DE POSTGRADO (CHILE): Incluye Beca equivalente al 15% de descuento para funcionarios de instituciones públicas o estatales chilenas y para alumnos de postgrado chilenos o extranjeros con residencia en Chile.
Matrícula para ALUMNOS EXTRANJEROS: Incluye Beca equivalente al 20% de descuento para alumnos extranjeros sin residencia en Chile.

EVALUACIÓN

La evaluación se realiza mediante un proyecto personal de análisis de datos de mejora genética y/o genómica aplicada:
Parte 1. Análisis exploratorio de datos fenotípicos, genéticos y/o genómicos. Pondera un 60% de la nota final.
Parte 2. Aplicación de métodos tradicionales o avanzados de mejora genética o genómica animal. Pondera un 40% de la nota final.

Nota de aprobación: La nota mínima de aprobación es un 4,0, en una escala de 1-7, con un 40% de exigencia.

ASISTENCIA

Para aprobar el curso los alumnos deben alcanzar un 80% de asistencia. Esto es independiente si la calificación del proyecto personal es igual o superior a 4,0.

¿DÓNDE TRABAJAN LOS GRADUADOS DE NUESTROS CURSOS Y DIPLOMADOS?

CHILE: ADL Diagnostic, Antufen Seeds, Aquabench, Aquachile, AquaGen, Austral-Omics, Blue Genomics Chile, Cargill Aqua Nutrition, Benchmark Genetics Chile SPA, Cargill Innovation Center, Cermaq, CESSO E.I.R.L., Centro IDEAL, Centro de entomología aplicada Ltda, Centro de Genómica Nutricional Agroacuícola, Consultores independientes, Electroarnez, Empresas Aquachile, Fraunhofer Chile, Fundación Ciencia y Vida, Farmacología en Aquacultura Veterinaria FAV S.A., Inacap, Instituto de Desarrollo Agropecuario (INDAP), Instituto de Investigaciones Agropecuarias de Chile (INIA), Invermar, Liceo Carmen Rodriguez Henriquez de Tongoy, MSD Salud Animal, ML Agroservicios, Mowi, MultiX, Salmones Antártica, Salmones Aysen, Salmones Blumar, Salmones Camanchaca, Salmones de Chile, Sernapesca, TAAG Genetics, Universidad Andrés Bello, U. Adolfo Ibáñez, U. Arturo Prat, U. de Chile, U. de los Lagos, U. de Antofagasta, U. del Alba, U. de Atacama, U. Austral de Chile, U. Católica de Temuco, U. Católica del Norte, Universidad San Sebastián, U. Santo Tomás, U. de la Frontera, U. de Valparaíso, U. de Talca, Universidad Técnica Federico Santa María, U. de Magallanes, U. de O’Higgins, U. de Playa Ancha, U. tecnológica Metropolitana, Pontificia Universidad Católica de Chile, Solver, Vitapro Chile, WSP Ambiental.

INTERNACIONAL: Argentina: Universidad de Buenos Aires, Ministerio de Producción y Agroindustria de la Provincia de Río Negro; Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (CONICET); Bolivia: Consultor independiente, Universidad Mayor de San Andrés; Brasil: Universidad de São Paulo, Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais; Canadá: Consultor independiente; Colombia: AGROSAVIA, U. Francisco de Paula Santander, Autoridad Nacional de Acuicultura y Pesca-Colombia, Universidad de La Sabana; Dubai: Pure Salmon; Ecuador: Agrantech, Alimentsa, Biomar, Cargill, GrupoAlmar, Hendrix Genetics, Holstein Ecuador, La Chamecita S.A.S., Produmar, Centro de Investigación Marina y Acuícola (CENAIM), Escuela Superior Politécnica del Litoral, Escuela Superior Politécnica Agropecuaria de Manabí, Ministerio de Agricultura y Ganadería, Universidad Estatal del Sur de Manabí, Universidad Estatal Amazónica, Universidad de Camagüey; Honduras: Universidad Nacional Autónoma de Honduras; España: Apeel Sciences Spain SL; México: Laboratorio Estatal de Salud Pública (LESP), Universidad de Nariño, Universidad Autonoma de Coahuila, U. Autónoma de Nayarit, Colegio de Postgraduados (Colpos), Laboratorios Vitalab, Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto Politécnico Nacional-CIIDIR Sinaloa, Instituto de Salud del Estado de Chiapas, Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR); Nueva Zelanda: New Zealand King Salmon; Perú: Instituto Nacional de Salud, Instituto Nacional de Innovación Agraria, Consultor independiente, Universidad Científica del Sur, Universidad Nacional Agraria La Molina, U. Nacional Jorge Basadre Grohmann, Universidad Nacional de Trujillo, Universidad del Tolima, Universidad Nacional del Altiplano, Universidad Nacional del Callao, Universidad Nacional del Santa, Universidad Nacional San Cristóbal de Huamanga; Organismo Nacional de Sanidad Pesquera y Acuícola; POOLFARM, PROGENETICS PERU EILR; Uruguay: Universidad de la República.