Curso intensivo Análisis de expresión diferencial de genes e investigación reproducible con R

06 – 29 de enero de 2025
Clases sincrónicas vía zoom
Lunes, miércoles y viernes 18:00 a 20:15 PM

DESCRIPCIÓN DEL CURSO

La tercera versión del curso «Análisis de expresión diferencial de genes e investigación reproducible con R» ofrece una oportunidad única para explorar el campo de la biología molecular y el análisis de expresión génica mediante PCR cuantitativo.

Dirigido a investigadores, estudiantes y profesionales de las ciencias biológicas, este curso proporciona los conocimientos y habilidades necesarios para realizar análisis de expresión diferencial de genes de manera reproducible usando el lenguaje de programación R.

Los participantes aprenderán desde los fundamentos de la extracción de ARN y el diseño de cebadores, hasta los aspectos clave para ejecutar PCR en tiempo real y analizar la expresión génica utilizando métodos como Delta-Delta Ct y Pfaffl. Además, el curso integra principios de Investigación Reproducible, enseñando a automatizar el análisis de calidad del ARN, el análisis estadístico y la creación de gráficos con R, facilitando la preparación de resultados para publicación.

PROGRAMA DEL CURSO

PERFIL DEL PARTICIPANTE

Profesionales, graduados o estudiantes de curso superior de las ciencias biológicas incluyendo Biología, Biología Marina, Bioquímica, Biotecnología, Microbiología y áreas afines a los recursos biológicos como la agronomía, la acuicultura, las ciencias veterinarias u otras.

DURACIÓN

40 horas de clases
22 sincrónicas – 18 horas de estudio personal y realización de tareas.

FECHAS Y HORARIOS DE CLASES

Fecha: 06 – 29 de enero de 2025
Horarios: Lunes, miércoles y viernes 18:00 a 20:15 PM.
Clases sincrónicas vía zoom – horario de Chile.

POSTULACIÓN, MATRÍCULAS Y BECAS

SIN CUPOS – CURSO CERRADO
Contacto: debora.torrealba@uoh.cl

REQUISITOS DE POSTULACIÓN

Estadística: curso aprobado de nivel universitario.
Inglés: Los softwares R y Rstudio, así como todas las librerías de análisis estadístico que se usarán en el curso solo están disponibles en inglés. Alumnos sin competencias de lectura en inglés no deberían tomar el curso.
Programación con R: Deseable pero no excluyente. Los alumnos sin experiencia previa en programación con R deben considerar 6 horas de estudio y autoaprendizaje adicional por semana para poder alcanzar una comprensión avanzada de los objetivos de aprendizaje del curso.

EQUIPO DOCENTE

Dra. Débora Torrealba.
Profesora asistente Universidad de O’Higgins, Chile.
Miembro de Asociación Latinoamericana de Genética
Grado académico de Doctora por la Universidad de Barcelona.

Dr. José Gallardo Matus.
Profesor titular en la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Chile.
Miembro de Asociación Latinoamericana de Genética
Grado académico de Doctor en Ciencias por la Universidad de Chile.

Dra. María Angélica Rueda Calderón
Profesor visitante en la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Chile.
Miembro de Asociación Latinoamericana de Genética.
Grado académico de Doctora en Ciencias Agropecuarias por la Universidad Nacional de Córdoba, Argentina.

PROGRAMA Y DETALLE DE ACTIVIDADES POR CLASE

Clase 1. Introducción al curso. Introducción a la biología molecular y al análisis de expresión de genes.
Clase 2. Programación con R: Importar y explorar datos de cuantificación y calidad de ARN.
Clase 3. Diseño de cebadores para qPCR.
Clase 4. Eficiencia de los cebadores y optimización de qPCR.
Clase 5. Programación con R: Visualización y manipulación de datos con ggplot2 y dplyr.
Clase 6. Diseño y ejecución de qPCR.
Clase 7. Genes de referencia.
Clase 8. Programación con R: Exploración de datos de CT.
Clase 9. Cálculo de la expresión génica relativa con los métodos Delta-Delta Ct y Pfaffl.
Clase 10. Programación con R: Inferencia estadística y análisis de expresión de genes.
Clase 11. Programación con R: Métodos no paramétricos para el análisis de expresión de genes.

RECURSOS DE APRENDIZAJE

– Rstudio: Cuenta Rstudio.cloud por 1 mes.
– Material docente: Clases, guías de aprendizaje y códigos de programación para el análisis de genes.

CERTIFICACIÓN

Se entregará certificación de PARTICIPACIÓN del curso a los alumnos que alcancen un 80% de asistencia a las clases sincrónicas y que realicen de forma satisfactoria el 80% de las tareas del curso con R.

La certificación oficial de PARTICIPACIÓN del curso se entregará durante la primera semana de marzo de 2025.

INFORME EVALUACIÓN CURSOS VERSIÓN 1 Y 2

¿QUE OPINAN LOS EX ALUMNOS DE ESTE CURSO?

Alumno 2023: Buen curso, cumplió mis expectativas y aporto mucho a mi conocimiento general.
Alumno 2023: Excelente curso y profesores, muy claro el material de clases y buena disposición a dudas.
Alumno 2023: Me ha gustado mucho el curso. Me ayudó a identificar las falencias y fortalezas que tenemos en el grupo de laboratorio. Además de ser un curso con temática actualizada y de gran relevancia en investigación.
Alumno 2022: Encuentro que fue un curso excelente, muy completo y con mucha coherencia en el orden de las clases.
Alumno 2022: A pesar de lo complejo que es trabajar con R, el curso en verdad ha sido claro y sencillo como introducción para alguien que no habia utilizado R anteriormente.
Alumno 2022: Agradezco la cordialidad y dedicación de los profesores, son temas complejos pero las clases fueron muy llevaderas y completas.

PATROCINA

Asociación Latinoamericana de Genética (ALAG).

Doctorado en Biotecnología – Programa conjunto entre la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso (PUCV) y la Universidad Técnica Federico Santa María.

ANID – Proyecto Fondecyt regular Nº 1231206

ANID – Fondecyt de Iniciación N° 11240684.